PRISE D’ANTIBIOTIQUES – DES DOMMAGES SUR LE MICROBIOTE

Selon une étude internationale, la prise d’antibiotiques est associée à une diminution de la diversité et de l’abondance des bactéries intestinales.

Une étude internationale publiée le 11 mars 2026 dans Nature Medicine, menée par des chercheurs des universités d’Uppsala et de Lund en Suède — encollaboration avec le Karolinska Institutet — révèle que certains antibiotiques modifient durablement le microbiome intestinal. Et pas pour quelques semaines : jusqu’à huit ans après la prise. L’étude porte sur près de 15 000 adultes suédois. Elle constitue, selon ses auteurs eux-mêmes, la preuve la plus solide à ce jour decet effet persistant sur la flore intestinale.
C’est la première fois qu’une association de ce type est observée sur une aussi longue période. « Ces résultats sont surprenants et assez inquiétants, compte tenu de la forte consommation d’antibiotiques », souligne Dominique Gauguier, directeur de recherche Inserm, qui n’a pas participé à l’étude. «L’altération de la flore intestinale est corrélée à de nombreuses maladies chroniques, comme le diabète.»
Le microbiote intestinal est constitué de plusieurs milliers de milliards de bactéries, mais aussi de virus et de champignons. Cet écosystème complexe joue un rôle clé dans la digestion, l’immunité et le métabolisme, et repose sur un équilibre fragile.
Lorsqu’un antibiotique est administré, il ne distingue pas les “bonnes” bactéries des “mauvaises”. « Résultat : une partie du microbiote est détruite, la diversité bactérienne diminue, et certaines espèces prennent le dessus », comme l’explique le Dr Benjamin Davido.